Protein–RNA interactions for Protein: P47226

Tes, Testin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TesP47226 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TesP47226 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TesP47226 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TesP47226 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TesP47226 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TesP47226 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TesP47226 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TesP47226 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TesP47226 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TesP47226 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TesP47226 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TesP47226 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TesP47226 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TesP47226 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TesP47226 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TesP47226 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TesP47226 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TesP47226 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TesP47226 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TesP47226 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TesP47226 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TesP47226 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TesP47226 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TesP47226 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TesP47226 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TesP47226 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TesP47226 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TesP47226 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TesP47226 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TesP47226 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TesP47226 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TesP47226 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TesP47226 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TesP47226 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TesP47226 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TesP47226 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TesP47226 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TesP47226 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TesP47226 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TesP47226 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TesP47226 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TesP47226 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TesP47226 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TesP47226 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TesP47226 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TesP47226 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TesP47226 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TesP47226 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TesP47226 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TesP47226 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TesP47226 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TesP47226 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TesP47226 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TesP47226 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TesP47226 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TesP47226 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TesP47226 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TesP47226 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TesP47226 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TesP47226 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TesP47226 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TesP47226 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TesP47226 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TesP47226 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TesP47226 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TesP47226 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TesP47226 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TesP47226 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms