Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic1P46684 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic1P46684 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic1P46684 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic1P46684 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zic1P46684 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zic1P46684 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic1P46684 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic1P46684 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic1P46684 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms