Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cdkn1bP46414 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms