Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sdc2P43407 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sdc2P43407 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sdc2P43407 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sdc2P43407 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms