Protein–RNA interactions for Protein: P43352

Rad52, DNA repair protein RAD52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad52P43352 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad52P43352 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad52P43352 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rad52P43352 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms