Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms