Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms