Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Elk1P41969 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Elk1P41969 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Elk1P41969 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Elk1P41969 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Elk1P41969 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Elk1P41969 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Elk1P41969 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Elk1P41969 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Elk1P41969 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Elk1P41969 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Elk1P41969 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Elk1P41969 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Elk1P41969 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Elk1P41969 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Elk1P41969 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Elk1P41969 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elk1P41969 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elk1P41969 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elk1P41969 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elk1P41969 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elk1P41969 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Elk1P41969 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Elk1P41969 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Elk1P41969 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms