Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tac1P41539 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tac1P41539 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tac1P41539 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tac1P41539 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tac1P41539 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms