Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf9P41274 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms