Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LtbP41155 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LtbP41155 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LtbP41155 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LtbP41155 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LtbP41155 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LtbP41155 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LtbP41155 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LtbP41155 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LtbP41155 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LtbP41155 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LtbP41155 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LtbP41155 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LtbP41155 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LtbP41155 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LtbP41155 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbP41155 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbP41155 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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LtbP41155 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbP41155 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbP41155 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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LtbP41155 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbP41155 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbP41155 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbP41155 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbP41155 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbP41155 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbP41155 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbP41155 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbP41155 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbP41155 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbP41155 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbP41155 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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