Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TfamP40630 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TfamP40630 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TfamP40630 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TfamP40630 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TfamP40630 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TfamP40630 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TfamP40630 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TfamP40630 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TfamP40630 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TfamP40630 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TfamP40630 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TfamP40630 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TfamP40630 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TfamP40630 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TfamP40630 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TfamP40630 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TfamP40630 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TfamP40630 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TfamP40630 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TfamP40630 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TfamP40630 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TfamP40630 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TfamP40630 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TfamP40630 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TfamP40630 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TfamP40630 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TfamP40630 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TfamP40630 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TfamP40630 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TfamP40630 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TfamP40630 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TfamP40630 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TfamP40630 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TfamP40630 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TfamP40630 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TfamP40630 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TfamP40630 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TfamP40630 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TfamP40630 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TfamP40630 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TfamP40630 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TfamP40630 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TfamP40630 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TfamP40630 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TfamP40630 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TfamP40630 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TfamP40630 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TfamP40630 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TfamP40630 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TfamP40630 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TfamP40630 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TfamP40630 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TfamP40630 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TfamP40630 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TfamP40630 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TfamP40630 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TfamP40630 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TfamP40630 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TfamP40630 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TfamP40630 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TfamP40630 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TfamP40630 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TfamP40630 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TfamP40630 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TfamP40630 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TfamP40630 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TfamP40630 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TfamP40630 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TfamP40630 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TfamP40630 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TfamP40630 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TfamP40630 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TfamP40630 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TfamP40630 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TfamP40630 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TfamP40630 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TfamP40630 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TfamP40630 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TfamP40630 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TfamP40630 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TfamP40630 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TfamP40630 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TfamP40630 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TfamP40630 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TfamP40630 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TfamP40630 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TfamP40630 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TfamP40630 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TfamP40630 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TfamP40630 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TfamP40630 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TfamP40630 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TfamP40630 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TfamP40630 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TfamP40630 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TfamP40630 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TfamP40630 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TfamP40630 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TfamP40630 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms