Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VhlP40338 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
VhlP40338 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VhlP40338 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VhlP40338 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VhlP40338 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VhlP40338 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VhlP40338 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VhlP40338 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VhlP40338 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VhlP40338 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VhlP40338 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VhlP40338 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VhlP40338 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VhlP40338 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VhlP40338 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VhlP40338 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VhlP40338 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
VhlP40338 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VhlP40338 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VhlP40338 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VhlP40338 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VhlP40338 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VhlP40338 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VhlP40338 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VhlP40338 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
VhlP40338 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VhlP40338 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VhlP40338 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VhlP40338 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VhlP40338 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VhlP40338 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms