Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ThpoP40226 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ThpoP40226 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ThpoP40226 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ThpoP40226 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ThpoP40226 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ThpoP40226 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ThpoP40226 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ThpoP40226 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms