Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3rP40223 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms