Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lig1P37913 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lig1P37913 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lig1P37913 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lig1P37913 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lig1P37913 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lig1P37913 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lig1P37913 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lig1P37913 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lig1P37913 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lig1P37913 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms