Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PpargP37238 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PpargP37238 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpargP37238 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpargP37238 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpargP37238 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpargP37238 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpargP37238 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpargP37238 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpargP37238 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpargP37238 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpargP37238 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PpargP37238 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpargP37238 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpargP37238 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpargP37238 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PpargP37238 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpargP37238 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpargP37238 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpargP37238 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpargP37238 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpargP37238 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpargP37238 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpargP37238 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpargP37238 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpargP37238 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpargP37238 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpargP37238 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpargP37238 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpargP37238 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpargP37238 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpargP37238 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PpargP37238 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpargP37238 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpargP37238 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpargP37238 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpargP37238 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpargP37238 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpargP37238 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpargP37238 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpargP37238 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpargP37238 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PpargP37238 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpargP37238 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpargP37238 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpargP37238 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpargP37238 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpargP37238 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpargP37238 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpargP37238 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpargP37238 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpargP37238 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpargP37238 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpargP37238 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpargP37238 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpargP37238 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpargP37238 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpargP37238 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpargP37238 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PpargP37238 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpargP37238 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpargP37238 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpargP37238 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpargP37238 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpargP37238 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpargP37238 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpargP37238 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpargP37238 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpargP37238 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PpargP37238 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpargP37238 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpargP37238 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpargP37238 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpargP37238 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpargP37238 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpargP37238 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.9 ms