Protein–RNA interactions for Protein: P37172

Acvr1, Activin receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1P37172 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acvr1P37172 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acvr1P37172 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms