Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin1P35438 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin1P35438 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin1P35438 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin1P35438 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin1P35438 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms