Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab21P35282 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab21P35282 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab21P35282 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab21P35282 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab21P35282 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab21P35282 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab21P35282 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab21P35282 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab21P35282 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab21P35282 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab21P35282 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab21P35282 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab21P35282 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab21P35282 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab21P35282 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab21P35282 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab21P35282 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab21P35282 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab21P35282 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab21P35282 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab21P35282 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab21P35282 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab21P35282 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab21P35282 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab21P35282 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab21P35282 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab21P35282 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab21P35282 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms