Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms