Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc3P33622 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms