Protein–RNA interactions for Protein: P31428

Dpep1, Dipeptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpep1P31428 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpep1P31428 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dpep1P31428 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms