Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou3f3P31361 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou3f3P31361 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou3f3P31361 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou3f3P31361 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou3f3P31361 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou3f3P31361 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou3f3P31361 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou3f3P31361 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou3f3P31361 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou3f3P31361 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou3f3P31361 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou3f3P31361 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou3f3P31361 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou3f3P31361 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou3f3P31361 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou3f3P31361 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms