Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms