Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc10P31257 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms