Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp1P29452 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp1P29452 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp1P29452 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp1P29452 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp1P29452 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Casp1P29452 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casp1P29452 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms