Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms