Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xrcc5P27641 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms