Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
U2af2P26369 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
U2af2P26369 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
U2af2P26369 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
U2af2P26369 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
U2af2P26369 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
U2af2P26369 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
U2af2P26369 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
U2af2P26369 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
U2af2P26369 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms