Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo2P25801 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms