Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NdnP25233 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NdnP25233 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NdnP25233 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NdnP25233 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NdnP25233 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NdnP25233 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NdnP25233 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NdnP25233 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NdnP25233 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NdnP25233 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NdnP25233 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NdnP25233 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NdnP25233 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
NdnP25233 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NdnP25233 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NdnP25233 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NdnP25233 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NdnP25233 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NdnP25233 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NdnP25233 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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