Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm44889-201ENSMUST00000207674 1019 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm29416-202ENSMUST00000191328 1201 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd11P23813 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
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