Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZfaP23607 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZfaP23607 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZfaP23607 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZfaP23607 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZfaP23607 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ZfaP23607 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZfaP23607 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZfaP23607 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZfaP23607 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZfaP23607 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms