Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ggta1P23336 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ggta1P23336 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms