Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja1P23242 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja1P23242 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja1P23242 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja1P23242 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja1P23242 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja1P23242 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja1P23242 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja1P23242 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms