Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PparaP23204 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PparaP23204 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PparaP23204 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PparaP23204 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PparaP23204 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PparaP23204 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PparaP23204 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PparaP23204 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PparaP23204 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PparaP23204 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PparaP23204 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PparaP23204 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PparaP23204 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PparaP23204 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PparaP23204 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PparaP23204 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PparaP23204 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PparaP23204 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PparaP23204 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PparaP23204 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PparaP23204 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PparaP23204 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PparaP23204 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PparaP23204 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PparaP23204 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PparaP23204 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PparaP23204 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PparaP23204 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PparaP23204 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PparaP23204 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PparaP23204 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PparaP23204 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PparaP23204 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PparaP23204 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PparaP23204 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PparaP23204 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PparaP23204 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PparaP23204 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PparaP23204 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PparaP23204 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
PparaP23204 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PparaP23204 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PparaP23204 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PparaP23204 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PparaP23204 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PparaP23204 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PparaP23204 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PparaP23204 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PparaP23204 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PparaP23204 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PparaP23204 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PparaP23204 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PparaP23204 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PparaP23204 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PparaP23204 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PparaP23204 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PparaP23204 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PparaP23204 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PparaP23204 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PparaP23204 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PparaP23204 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PparaP23204 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PparaP23204 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PparaP23204 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PparaP23204 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PparaP23204 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PparaP23204 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PparaP23204 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PparaP23204 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PparaP23204 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PparaP23204 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PparaP23204 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PparaP23204 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PparaP23204 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PparaP23204 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PparaP23204 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms