Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cbx3P23198 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms