Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms