Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcaP20444 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcaP20444 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms