Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PdgfaP20033 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PdgfaP20033 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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PdgfaP20033 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms