Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama1P19137 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama1P19137 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama1P19137 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama1P19137 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama1P19137 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama1P19137 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Lama1P19137 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama1P19137 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama1P19137 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama1P19137 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama1P19137 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama1P19137 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama1P19137 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama1P19137 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama1P19137 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama1P19137 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms