Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
P18528 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
P18528 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18528 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18528 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18528 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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