Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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