Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-D1P14427 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms