Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb1P12658 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb1P12658 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms