Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga5P11688 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga5P11688 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga5P11688 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga5P11688 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga5P11688 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga5P11688 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms