Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms