Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeflP08551 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeflP08551 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeflP08551 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeflP08551 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeflP08551 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeflP08551 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeflP08551 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeflP08551 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NeflP08551 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NeflP08551 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NeflP08551 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NeflP08551 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeflP08551 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeflP08551 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeflP08551 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeflP08551 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeflP08551 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeflP08551 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeflP08551 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeflP08551 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeflP08551 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeflP08551 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeflP08551 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeflP08551 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeflP08551 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeflP08551 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeflP08551 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeflP08551 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NeflP08551 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NeflP08551 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NeflP08551 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NeflP08551 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NeflP08551 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NeflP08551 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NeflP08551 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NeflP08551 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NeflP08551 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NeflP08551 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NeflP08551 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NeflP08551 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NeflP08551 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NeflP08551 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NeflP08551 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NeflP08551 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NeflP08551 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NeflP08551 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NeflP08551 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NeflP08551 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NeflP08551 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NeflP08551 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NeflP08551 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms