Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-T23P06339 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-T23P06339 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-T23P06339 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-T23P06339 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-T23P06339 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-T23P06339 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-T23P06339 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-T23P06339 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-T23P06339 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-T23P06339 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-T23P06339 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms